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    蛋白泛素化修飾（Ubiquitination）

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    蛋白泛素化修飾（Ubiquitination）

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         蛋白泛素化修飾（Ubiquitination）常伴隨泛素-蛋白酶體降解，引起蛋白穩(wěn)定性變化，參與增殖凋亡、內(nèi)吞、免疫等各種生物調(diào)控過程。其發(fā)生過程是通過一個三酶級聯(lián) (E1-E2-E3)反應(yīng)，使得單或多個泛素分子連接到蛋白氨基酸（Lys）側(cè)鏈上，并常伴隨蛋白酶體降解，調(diào)控蛋白表達水平變化。發(fā)生泛素化修飾的賴氨酸共價連接泛素分子，即兩個甘氨酸K-ε-GG殘基，使分子量產(chǎn)生114.1 Da的質(zhì)量偏移。利用質(zhì)譜可準確測定分子量是否發(fā)生114.1Da的質(zhì)量偏移，從而檢測泛素化修飾肽段及位點。 4D-label free泛素化蛋白組學(xué)是基于timsTOF Pro質(zhì)譜儀，通過數(shù)據(jù)依賴性采集-同步累積連續(xù)碎裂（ddaPASEF）掃描模式進行泛素化差異蛋白質(zhì)組學(xué)分析。4D-label free修飾組，利用了離子淌度分離，能根據(jù)分子的形狀、截面積屬性，可有效區(qū)分修飾同分異構(gòu)多肽，極大提高修飾的鑒定深度，以更少上樣量、更快掃描速度，實現(xiàn)蛋白質(zhì)組學(xué)在覆蓋深度、靈敏度、通量方面的全面性提升。

    技術(shù)路線

    技術(shù)優(yōu)勢

    1. 4D技術(shù)加持，提高定量的準確性、鑒定深度，更加適合微量樣本；

    2. 克服標記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在樣本數(shù)量上的限制，靈活方便；

    3. 基于質(zhì)譜平臺（Bruker timsTOF pro），檢測速度提升近一倍；

    4. 經(jīng)驗豐富——超18年蛋白平臺服務(wù)經(jīng)驗，擁有豐富的高水平項目文章；

    5. 數(shù)據(jù)保證——采用進口金標抗體，數(shù)據(jù)結(jié)果穩(wěn)定可靠；

    6. 系統(tǒng)解決方案——提供修飾組學(xué)至驗證、上下游聯(lián)合分析，實現(xiàn)快捷”一站式”服務(wù)。

    數(shù)據(jù)分析

    1、標準數(shù)據(jù)分析內(nèi)容

    鑒定分析：鑒定與定量結(jié)果統(tǒng)計;單個樣本蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果統(tǒng)計;韋恩圖。

    表達差異分析：差異結(jié)果統(tǒng)計;差異結(jié)果柱狀圖;火山圖;聚類分析圖。

    多組的比較分析(組別>=3)：mufzz聚類;雷達圖;箱線圖。

    功能分析：亞細胞定位;結(jié)構(gòu)域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作網(wǎng)絡(luò)分析。

    質(zhì)量控制分析：肽段離子質(zhì)量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白質(zhì)豐度比分布。

    2、高級數(shù)據(jù)分析

    功能分析：GSEA富集分析。

    臨床藥物研究：藥物靶點注釋。

    標志物篩選：集成機器學(xué)習(xí)。

    與臨床表征的聯(lián)合分析：熱圖;弦圖;ROC分析;WGCNA分析。

    推薦組合產(chǎn)品

    蛋白表達水平全面解析：轉(zhuǎn)錄組+蛋白組+泛素化組。

    推薦應(yīng)用領(lǐng)域

    1. 植物發(fā)育與抗逆；

    2. 感染與免疫研究；

    3. 衰老再生及退行性疾病。


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    項目案例

    蛋白泛素化修飾（Ubiquitination）

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