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項目介紹

對感興趣的蛋白進行功能注釋，以便于理解這些蛋白的各種生物學意義。功能注釋包括：Gene Ontology 功能，KEGG 通路，蛋白結構域，亞細胞定位，Complex ( 復合體 )，COG/KOG 注釋。

Gene Ontology分析

GO 分析是一種能夠將基因與基因產物（如蛋白質）的各項信息有機聯系在一起的生物信息學分析方法，包括 Biological Process（生物進程），Cellular Component（細胞組成），Molecular Function（分子功能）。主要來源于 UniProt-GOA 數據庫，并使用 InterProScan 預測進行補充注釋。

KEGG通路注釋

KEGG 是系統分析蛋白和化合物在細胞中的代謝途徑以及蛋白功能的數據庫。使用 KEGG 在線服務工具 KAAS 和 KEGG mapper 獲取 KEGG 通路注釋的結果。

蛋白結構域注釋

蛋白結構域是蛋白質中在序列上具有保守性，且一般情況下可以獨立行使功能的特定蛋白區域，與蛋白質完成生理功能有著密切的關系，經常被用于蛋白質分子進化和功能學的研究。我們基于 Pfam、SMART 和 Interpro 等數據庫提供蛋白質結構域的功能注釋信息。

亞細胞定位

蛋白質只有轉運到正確的位置才能參與細胞的各種生命活動，我們對真核生物和原核生物分別使用 wolfpsort 軟件和 CELLO 軟件預測蛋白質的亞細胞結構定位信息。

Complex(復合體)

蛋白復合體是由兩個以上功能相關的蛋白通過二硫鍵或其它蛋白質相互作用所形成的復合物。蛋白復合體種類繁多，很多性質和功能還未研究透徹，是蛋白質組學的重要研究對象。我們基于 CORUM 網站進行蛋白質復合體的注釋（僅針對人和小鼠兩個物種）。

COG/KOG注釋

COG，即 Clusters of Orthologous Groups of proteins。構成每個 COG 的蛋白都是被假定為來自于一個祖先蛋白，并且因此或者是直系同源蛋白（orthologs）或者是旁系同源蛋白（paralogs）。原核生物的一般稱為 COG 數據庫；真核生物的一般稱為 KOG 數據庫?；?COG/KOG 數據庫進行蛋白質功能注釋，可以準確地確定 orthologs 和 paralogs。

樣品要求

詳情請聯系技術經理。

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