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長鏈非編碼RNA(lncRNA)

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長鏈非編碼RNA(lncRNA)

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項目介紹

長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類轉錄本長度超過200 nt的RNA分子,它們不編碼蛋白。lncRNA的表達受到發育調控,是組織和細胞特異的。相當一部分lncRNA只位于細胞核內。它們包含許多類型的轉錄本,在結構上類似mRNA,有時也轉錄成編碼基因的反義轉錄本。lncRNA被認為執行了重要的調控功能,也與疾病發展息息相關。

技術特點

 1. lncRNA在不同的發育階段lncRNA的表達水平不同

 2. 在不同的癌組織或其他疾病中,lncRNA差異性表達

 3. LncRNA的調控機制多元化、復雜性高,在細胞中存在數量是mRNA的3~100倍

技術流程

圖中深色為該技術流程

分析流程:

標準分析

(1) 數據過濾及比對分析

(2) 轉錄本拼接

高級分析

(3) LncRNA的篩選及分析

(4) 靶基因預測

(5) 差異基因GO/KEGG分析,推測突變基因富集在哪些代謝通路。

樣品要求

樣本要求:

RNA濃度≥20ng/ul 總量≥2ug    

細胞數≥5X106

項目案例

差異分析聚類圖

靶基預測圖

學術文章

長鏈非編碼RNA(lncRNA)

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