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    長鏈非編碼RNA(lncRNA)

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    長鏈非編碼RNA(lncRNA)

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    項目介紹

    長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類轉(zhuǎn)錄本長度超過200 nt的RNA分子,它們不編碼蛋白。lncRNA的表達(dá)受到發(fā)育調(diào)控,是組織和細(xì)胞特異的。相當(dāng)一部分lncRNA只位于細(xì)胞核內(nèi)。它們包含許多類型的轉(zhuǎn)錄本,在結(jié)構(gòu)上類似mRNA,有時也轉(zhuǎn)錄成編碼基因的反義轉(zhuǎn)錄本。lncRNA被認(rèn)為執(zhí)行了重要的調(diào)控功能,也與疾病發(fā)展息息相關(guān)。

    技術(shù)特點

     1. lncRNA在不同的發(fā)育階段lncRNA的表達(dá)水平不同

     2. 在不同的癌組織或其他疾病中,lncRNA差異性表達(dá)

     3. LncRNA的調(diào)控機(jī)制多元化、復(fù)雜性高,在細(xì)胞中存在數(shù)量是mRNA的3~100倍

    技術(shù)流程

    圖中深色為該技術(shù)流程

    分析流程:

    標(biāo)準(zhǔn)分析

    (1) 數(shù)據(jù)過濾及比對分析

    (2) 轉(zhuǎn)錄本拼接

    高級分析

    (3) LncRNA的篩選及分析

    (4) 靶基因預(yù)測

    (5) 差異基因GO/KEGG分析,推測突變基因富集在哪些代謝通路。

    樣品要求

    樣本要求:

    RNA濃度≥20ng/ul 總量≥2ug    

    細(xì)胞數(shù)≥5X106

    項目案例

    差異分析聚類圖

    靶基預(yù)測圖

    長鏈非編碼RNA(lncRNA)

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