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    蛋白質乙酰化修飾

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    蛋白質乙酰化修飾

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         蛋白質乙酰化修飾由乙酰基轉移酶和去乙酰化酶共同調節,通過感應代謝環境變化而變化,同時其常在代謝酶上發生修飾,進而調控代謝通路及代謝酶的活性,參與下游代謝物變化。蛋白質乙酰化(acetylation)是最常見的酰化修飾類型,是指在乙酰基轉移酶的催化下把乙酰基團(如乙酰輔酶A等供體)共價結合到底物蛋白質的賴氨酸殘基上的過程,主要發生在蛋白質賴氨酸殘基的ε-NH2位,其分子質量會相應增加42.01Da,質譜能夠準確地測定分子量是否發生相應的質量偏移,實現酰化修飾肽段及位點的分析。 4D-label free乙酰化修飾蛋白組學是基于timsTOF Pro質譜儀,通過數據依賴性采集-同步累積連續碎裂(ddaPASEF)掃描模式進行乙酰化差異蛋白質組學分析。4D-label free修飾組,利用了離子淌度分離,能根據分子的形狀、截面積屬性,可有效區分修飾同分異構多肽,極大提高修飾的鑒定深度,以更少上樣量、更快掃描速度,實現蛋白質組學在覆蓋深度、靈敏度、通量方面的全面性提升。

    技術路線

    技術優勢

    1. 4D技術加持,提高定量的準確性、鑒定深度,更加適合微量樣本;

    2. 克服標記定量蛋白質組學技術在樣本數量上的限制,靈活方便;

    3. 基于質譜平臺(Bruker timsTOF pro),檢測速度提升近一倍;

    4. 經驗豐富——超18年蛋白平臺服務經驗,擁有豐富的高水平項目文章;

    5. 數據保證——采用進口金標抗體,數據結果穩定可靠;

    6. 系統解決方案——提供修飾組學至驗證、上下游聯合分析,實現快捷”一站式”服務。

    數據分析

    1、標準數據分析內容

    鑒定分析:鑒定與定量結果統計;單個樣本蛋白質鑒定結果統計;韋恩圖。

    表達差異分析:差異結果統計;差異結果柱狀圖;火山圖;聚類分析圖。

    多組的比較分析(組別>=3):mufzz聚類;雷達圖;箱線圖。

    功能分析:亞細胞定位;結構域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作網絡分析。

    質量控制分析:肽段離子質量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白質豐度比分布。

    2、高級數據分析

    功能分析:GSEA富集分析。

    臨床藥物研究:藥物靶點注釋。

    標志物篩選:集成機器學習。

    與臨床表征的聯合分析:熱圖;弦圖;ROC分析;WGCNA分析。

    推薦組合產品

    打通表型-機制研究:乙酰化組+代謝組。

    推薦應用領域

    能量代謝調控;

    代謝綜合征研究;

    真菌細菌研究。

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