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項目介紹

Visium空間轉錄組測序是依靠10x Genomics Visium平臺，結合顯微成像、靶向探針捕獲、芯片和測序技術，從切片中獲取不同位置細胞中轉錄組數據，并將組織學和基因表達分析結合，通過數據處理進行基因表達和形態學數據的可視化。

技術原理

10x Genomics Visium的核心是利用空間表達芯片捕獲分子并標記空間位置和標簽，基因表達芯片包含4個點陣區域（6.5mm x 6.5mm），每個點陣含有4992個barcoded spot（直徑55um），每一個spot有一種空間定位條形碼。基因表達芯片上的組織切片透化后釋放mRNA被spot上對應的條形碼原位捕獲，進一步文庫構建和測序。測序數據中空間條形碼序列將轉錄信息映射回組織切片中的起始位置，從而還原轉錄本在組織中額位置分布，實現基因表達的空間可視化。